醉驾案件由 公安机关交通管理部门负责处理。具体来说，醉驾行为由公安机关进行立案侦查，公安机关在发现醉驾行为后，应当立即对醉驾人员进行控制，并依法检查血液中的酒精含量。如果达到醉驾标准，将依法追究刑事责任，并吊销机动车驾驶证。
此外，醉酒驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门约束至酒醒，吊销机动车驾驶证，依法追究刑事责任；五年内不得重新取得机动车驾驶证。
综上所述，醉驾案件的处理部门是公安机关交通管理部门，其职责包括对醉驾行为进行立案侦查、约束醉驾人员至酒醒、吊销驾驶证以及依法追究刑事责任等。
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